IBBM busca bioinformático

El Instituto de Biotecnología y Biología Molecular del CCT La Plata,  llama a concurso abierto de antecedentes para cubrir un cargo en la Carrera de Personal de Apoyo a la Investigación y Desarrollo de CONICET, en la categoría de Profesional para desarrollar tareas bioinformáticas en proyectos de genómica, transcriptómica y proteómica.

Fecha de apertura: 21 de agosto de 2012
Fecha de cierre: 14 de septiembre de 2012

 

Tareas a realizar:

 

Manejo de secuencias, estudios filogenéticos y predicciones funcionales:
  • Manejar bases de datos locales y a distancia.
  • Realizar mantenimiento de bases de datos locales.
  • Realizar búsquedas de secuencias de ácidos nucleicos y proteínas, edición de secuencias (Vector NTI, DNAStar, y utilitarios similares).
  • Efectuar estudios evolutivos y filogenéticos (ClustalW, Mega5, Phylip, Paup, PhyML, HyPhy).
  • Realizar la predicción de localización subcelular (pSort, uso de programas locales y servidores web).
  • Manejar programas relacionados a estudios proteómicos (identificación por PMF via MASCOT online e in-house, y equivalentes).
  • Manejar software para la identificación de microorganismos por huella peptídica (BioTyper).
  • Operar programas de prospección funcional por búsquedas por homología secuencia-secuencia (BLAST), secuencia-profile (Psiblas), profile-profile (FFAS), HMM-HMM (HHMER, HhPred).
  • Manejar métodos de predicción funcional por similitud estructural, evolutionary trace (mammoth Consurf).
  • Efectuar el modelado de proteínas (Modeller, scripting en Modeller, PyMol, DBali) y predicciones de interacciones proteína-proteína.
  • Encargarse de la instalación y mantenimiento de todos los programas mencionados en posibles servidores locales.

Apoyo informático a estudios genómicos y transcriptómicos:

  • Participar en el ensamblado, cuantificación y anotación de datos obtenidos por secuenciación genómica/transcriptómica masiva desde distintas plataformas (Illumina, 454-Roche, Ion Torrent).
  • Generar bases de datos y plataformas para su acceso y análisis.
  • Manejar software de ensamblado y cuantificación (R, Velvet, Casava, GenDB, metaSAMS y equivalentes).
  • Procesar y analizar datos provenientes de microarreglos/estudios de expresión/abundancia génica estimada por secuenciación.
  • Identificar y analizar pequeños RNAs: predicción de estructuras (mfold), búsqueda en bases de datos como miRbase e identificación a partir de datos de secuenciación.
  • Realizar las tareas atendiendo las normas de seguridad y bioseguridad establecidas por la Unidad.
  • Colaborar y brindar apoyo a los miembros del Instituto para la confección de rutinas bioinformáticas creadas “in house” para el procesamiento local de datos asociados a las distintas líneas de trabajo de la Unidad.
  • Supervisar a los distintos usuarios del servicio.
  • Asistir en el diagnóstico y la reparación de las deficiencias de hardware y software, identificar al servicio técnico pertinente y gestionar el servicio de reparación cuando se lo requiera.
  • Asistir a cursos de formación y perfeccionamiento.
Requisitos para los postulantes:
  • Título universitario, preferentemente en Informática o Ciencias Exactas y Naturales.
  • Poseer un buen nivel de conocimientos de inglés técnico (lecto-escritura).
  • Experiencia de al menos un año en tareas relacionadas con la bioinformática asociadas a análisis de secuencias a nivel global.
  • Conocimiento básico de algunos de los siguientes lenguajes informáticos (C++, Perl, Python, Java) y al menos una tecnología Web (HTML, CSS, Javascript/ECMAScript, PHP, Java o .NET/ASP).
  • Manejo general de sistema operativo y programas basados en Linux y Windows.
  • Conocimientos básicos de bioestadística (soft R, otros).
  • Capacidad para trabajar en equipo y disposición para entrenar a otros.
  • Capacidad de transmisión de conocimiento.
  • Disponibilidad para realizar cursos de perfeccionamiento.
  • Ser argentino nativo, o naturalizado.
  • El cargo a cubrir se encuadra en el régimen establecido por la Ley 20464 para el personal de Apoyo a la Investigación y Desarrollo  de CONICET.
  • Los interesados deben cumplir con los requisitos establecidos en la Ley Marco de Regulación de Empleo Público Nacional, Ley 25164 y su Dec. de Empleo Reglamentario N°1421/02.
Enviar:
  • Curriculum vitae
  • Nota de elevación dirigida al Director de IBBM, Dr. O. Mario Aguilar
  • Fotocopia del DNI (hojas 1 y 2)
  • Fotocopia del título.
Presentación:
Por correo electrónico a: ibbm@biol.unlp.edu.ar
Asunto: Cargo Profesional Bioinformática
Los postulantes que cumplan con los requisitos de inscripción y sean preseleccionados por el Comité de Selección serán citados telefónicamente o por e-mail para una entrevista personal.

 

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