Curso de genómica funcional

El Instituto de Genética Veterinaria (IGEVET), de la Facultad de Ciencias Veterinarias, Universidad Nacional de La Plata organiza un curso sobre genómica funcional. Los objetivos son desarrollar metodologías en el manejo de bases de datos, análisis estadístico y en la minería de datos de perfiles de expresión genómica derivados de microarreglos de ADNSAGE.

EL curso está dirigido a aquellas persona involucradas en la realización de estudios de genómica funcional estrechamente relacionados con investigación básica o aplicada en las áreas de genética microbiana, animal y humana.


Introducción a la genómica funcional

Estudios de expresión génica y su evolución desde las metodologías de “fuerza bruta” a las tecnologías de alta procesividad. Objetivos y alcances de la genómica funcional. Bases de la bioinformática aplicada al análisis de datos en transcriptómica. Secuenciadores denueva generación y sus aplicaciones al análisis de transcriptomas. Metodologías de validación con RT-PCR cuantitativa de tiempo real.

Estadística y minería de datos de transcriptomas

Características generales del entorno bioinformático para la administración, procesamiento y análisis de datos. Introducción a los principales métodos estadísticos con aplicación en genómica funcional. Descripción de métodos

estadísticos supervisados y métodos estadísticos no supervisados. Instalación y uso de programas estadístico y de minería de datos para el análisis de expresión genómica: nociones de BioconductorR-projectLIMMAMultiExperiment Viewer 4.4DAVIDSTRING, etc. Comparación de perfiles de expresión génica entre diferentes plataformas. Meta-análisis de datos.

Manejo de los principales repositorios de transcriptomas

Introducción al desarrollo de aplicaciones web. Concepto y estructura de una base de datos relacional. Descripción y uso de bases de datos publicas: GEOArray Express, etc. Búsqueda de genes diferencialmente expresados en distintas especies y condiciones experimentales. Empleo de bases de datos públicas para la búsqueda de genes de interés personal/grupal, para la generación de nuevas hipótesis y para sustentar datos experimentales en publicaciones científicas.

Más información:
Cursos de posgrado en FCV

bioinfomica.com.ar

Inscripción: Secretaría de Postgrado, Facultad de Ciencias Vet. UNLP. (Inscripción curso)

 

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