Archivo de ‘Artículos’
Folding@Home
Por Germán González Folding@Home (FAH) es un proyecto de la Universidad de Stanford que estudia el plegamiento proteico y las enfermedades relacionadas mediante métodos de computación distribuida. Con esto logra simular el plegamiento en un rango de 5-10 microsegundos, una escala mejor que las obtenidas con anterioridad. A diferencia de otros proyectos de computación distribuida, Folding@home es [...]
Algoritmo BLAST
Por Germán González El algoritmo y el programa de computadora que lo implementa fueron desarrollados por: Stephen Altschul, Warren Gish, David Lipman en el Centro Nacional de Información Biotecnológica (NCBI, por sus siglas en inglés), Webb Millar en la Universidad estatal de Pennsylvania, y Gene Myers en la Universidad de Arizona. Existen implementaciones alternativas comoWU-BLAST y FSA-BLAST. El [...]
Algoritmo Needleman-Wunsch
Por Germán González El algoritmo Needleman-Wunsch realiza un alineamiento global de dos secuencias (aquí llamadas A y B). Es comúnmente usado en bioinformática para alinear secuencias de nucleótidos o proteínas. Fue propuesto en 1970 por Saul Needleman y Christian Wunsch en su paper A general method applicable to the search for similarities in the amino acid sequence [...]
La bioinformática: una ciencia de riesgo
Por Antino Segura (cienciaalacarta@gmail.com). Publicado originalmente en: Pensamientos Aleatorios (http://penaleat.blogspot.com/2007/03/la-bioinfrmatica-una-ciencia-de-riesgo.html) Siempre he envidiado a la gente que ante la pregunta “Y tú… ¿qué haces?” puede dar una respuesta sencilla. En una fiesta, o en el autobús, tanto si quieres intimar más con la persona que te ha dirigido esa pregunta como si quieres librarte [...]
¿Qués es la biomatemática?
La biomatemática (o matemática biológica) es una rama de la ciencia encargada de modelar los procesos biológicas mediante técnicas propias de las matemáticas. Se podría decir que la biomatemática es el soporte teórico en el cual se apoya la bioinformática para realizar sus tareas, ya sea el secuenciamiento del genoma o más directamente las simulaciones [...]
Algoritmo Knuth–Morris–Pratt
El algoritmo para búsqueda de cadenas Knuth–Morris–Pratt (KMP) busca la aparición de una palabra P dentro de una “cadena de texto” principal C, empleando la simple observación de que cuando no sucede una coincidencia, la palabra misma contiene suficiente información para determinar cuando puede ocurrir la siguiente coincidencia, reexaminando caracteres previamente coincidentes. El algoritmo fue [...]
