Bioinformaticos

Por Sebastian Bassi [sbassi@genesdigitales.com], Virginia González, Gustavo Parisi. Traducido por: Germán González La biología computacional es una ciencia interdisciplinaria que surge a partir de campos disímiles como matemática, química, estadística, física, biología y ciencias de la computación. Aunque la definición exacta de la biología computacional está lejos de ser precisa e inequívoca, es un hecho que [...]

Publicado originalmente por CLC bio bajo licencia Creative Commons. Traducido por Juan Pablo Bustamante y Victoria Dumas La importancia de los péptidos señal fue demostrada en 1999 cuando Günter Blobel recibió el Premio Nobel en fisiología y medicina por su descubrimiento de que “las proteínas tienen señales intrínsecas que gobiernan su transporte y localización en [...]

Por Mathieu Fourment y Michael R Gillings. Traducido por Germán González Los análisis bioinformáticos involucran una amplia gama de de tareas y procesos. Se han escrito diversos programas para varias aplicaciones bioinformáticas usando cada lenguaje disponible. A causa del tamaño de los conjuntos de datos en bioinformática, el tiempo computacional no es trivial y es deseable [...]

Por Federico Abascal, David Posada, Robin D. Knight, Rafael Zardoya Traducido por Germán González El código genético provee la tabla de traducción necesaria para transformar la información contenida en el ADN al lenguaje de proteínas. En esta tabla, la correspondencia entre cada codón y cada aminoácido es establecida: el ARNt es el adaptador principal que [...]

Por Florencia Luna. Publicado originalmente en la revista Noticias ¿Qué es esto de la bioética? ¿Qué relación tiene con cuestiones tan disímiles como la genética o las investigaciones en células germinales, la pobreza, la injusticia o los derechos humanos? ¿Hay problemas de bioética que son particularmente relevantes para ciertos países? La bioética es una disciplina reciente pero [...]

Por Germán González Rie Takahashi y Jeffrey H Millar han hecho un esfuerzo por lograr que la ciencia se acerque al público general. Su idea fue convertir secuencias de proteínas en notas musicales pero intentando no perder la musicalidad. La meta del trabajo era convertir las secuencias genómicas en notas de piano que suenen razonables para [...]

Por Germán González El algoritmo FASTA es un método heurístico para comparación de cadenas. Fue desarrollado por Lipman y Pearson en 1985 y luego mejorado en 1988. FASTA compara una cadena de consulta con una cadena de un solo texto. Cuando buscamos en una base de datos entera coincidencias para una consulta dada, comparamos la consulta [...]

Por Juan Pablo Bustamante Los procesos que ocurren en los seres vivos constituyen algunos de los mecanismos más eficientes para procesar información.El código genético es una de las maquinarias más eficientes y compactas para procesarla y almacenarla. De ahí el creciente interés que la biología ha despertado a los investigadores de las ciencias computacionales en los [...]

Pblicado originalmente por CLC bio bajo licencia Creative Commons. Traducido por Germán González La búsqueda en bases de datos es ampliamente utilizada en bioinformática y hay un gran número de diferentes maneras de buscar en, por ejemplo, bases de datos de proteínas. Los algoritmos de alineamiento como BLAST [Altschul et al., 1990] ySmith-Waterman [Smith and Waterman, [...]

Por Germán González El algoritmo Smith-Waterman es un famoso algoritmo para realizar alineamientos locales de secuencias; esto es, determinar regiones similares entre dos secuencias de nucleótidos o proteínas. El algoritmo fue propuesto por Temple Smith y Michael Waterman en 1981. Como el algoritmo Needleman-Wunsch, del cual es una variación, Smith-Waterman es un algoritmo de programación dinámica. Como tal, [...]